খানসামা উপজেলার নামকরণের পিছনে সুনির্দিষ্ট কোন তথ্য পাওয়া যায়নি।তবে কথিত আছে যে,অত্র খানসামা উপজেলায় বৃটিশ আমলে একজন ইংরেজ কায্যপলক্ষে বসবাস করতেন। সেই ইংরেজ সাহেবের একজন খানসামা বা চাকর ছিলেন। পরবর্তীতে সেই খানসামার প্রচেষ্টায় অত্র এলাকায় একটি হাট গড়ে উঠে। উক্ত হাটটি তার নাম অনুসারে রাখা হয় খানসামা। সেই অনুসারে অত্র উজেলার নামকরন ১৮৯১ ইং সালের ২১শে জানুয়ারী খানসামা করা হয়। এই তথ্য ভারপ্রাপ্ত পুলিশ কর্মকর্তার ভূমি ও ইমারত কোঠা রেজিষ্টার ফাইলে পাওয়া যায়।১২/১২/১৯৮২ খ্রিঃ তারিখ জনাব তুষার কান্তি বড়ুয়া প্রথম উপজেলা নির্বাহী অফিসার হিসেবে দ্বায়িত্ব গ্রহন করেন।